外表落魄邋遢的浪人武士三十郎（三船敏郎飾）來到一個小鎮，清兵衛（河津清三郎飾）和新田丑寅（山茶花究飾）兩家惡霸在那里為爭奪地盤，招兵買馬經常爭斗，弄得民不聊生。
第二次世界大戰末期，日本在華北戰場已顯頹勢。在某山谷中，日軍獨立第九十小分隊被困在此地，不得動彈。這支隊伍成員來自各個連隊，被人戲稱為“獨立愚連隊”。困于絕地的
南太平洋進行了一起核實驗，“龍神丸二號”可能是此核實驗的受害者。就在龍神丸二號出事不久，東京就發生了一系列詭異的事件，一個叫三崎的罪犯突然蒸發但卻留下了他的衣服
寶石が謎の生物によって奪われるという事件が多発した。それは、炭素を主食とする宇宙生物?ドゴラの仕業であった。巨大なクラゲのようなドゴラには、地球上の如何なる兵器
