在第一季結尾，Wournos警長因不堪忍受超自然力量的折磨選擇「自毀」。臨死前，他叮囑Nathan接管警長職位繼續保護港灣鎮，并透露有人不希望Audrey歸來。Audrey向Nathan坦白Lucy實為其前世化身，而Nathan首次感知到Audrey的觸碰能力。自稱聯邦調查局探員Audrey Parker的女人突然現身，要求解釋超自然現象真相。第二季中，港灣鎮長之子Chris Brody（Jason Priestley飾）登場，作為擁有操控能量能力的超自然個體攪動局勢。Duke的妻子Evi Ryan（Vinessa Antoine飾）神秘回歸，其真實意圖引發眾人猜疑。首集里Audrey和Nathan發現致命瘟疫正被超自然力量引入鎮內，同時Audrey遭遇擁有完整記憶與身份的黑發「自己」。隨著調查深入，Audrey發現自己的存在與17世紀馬薩諸塞灣殖民地的超自然災難直接相關，而Chris Brody的真實身份正是古神提豐之子。Nathan逐漸覺醒的疼痛共感能力成為對抗超自然威脅的關鍵，Evi則在暗中實施分裂港口鎮居民的計劃。整季圍繞Audrey身份之謎、瘟疫事件平息以及超自然力量對鎮民意識的侵蝕展開。