雨果（劉校妤配音）因與父親爭(zhēng)吵離家出走，來(lái)到神秘世界尋找好友啦啦（孟泉霖配音）和熊大叔（陸揆配音），三人重逢后意外卷入鼠族首領(lǐng)番薯（林強(qiáng)配音）的陰謀。番薯企圖通過(guò)控制水資源奴役所有族群，其子米粒（楊天翔配音）因反對(duì)父親暴行而暗中協(xié)助雨果一行，共同踏上尋找水源頭的冒險(xiǎn)。眾人在旅途中屢次遭遇鼠族爪牙襲擊，并發(fā)現(xiàn)番薯早已利用古老機(jī)關(guān)封鎖水源，最終在米粒的自我犧牲下成功摧毀控制裝置。隨著水脈恢復(fù)流動(dòng)，番薯的統(tǒng)治徹底瓦解，神秘世界重歸平衡，雨果也帶著新的成長(zhǎng)與啦啦等人告別返回現(xiàn)實(shí)世界。