曾掀起連番江湖紛爭的倚天劍屠龍刀終由明教教主張無忌（爾冬升飾）收管，而九陰九陽兩部秘笈分別交予周芷若、張無忌。不久朱元璋登基成為皇帝，宋青書（萬梓良飾）憑高超的武功與易容術入宮擔任國師，處心積慮謀取幾樣武林至寶不表。宋青書設計殺害周芷若取得《九陰真經》。張無忌回訪蒙古第一高手鐵真將軍（狄龍飾）時偶遇宋青書命人襲擊蒙古邊民嫁禍明教，張無忌只得隱藏身份救下蒙古公主（鐘楚紅飾），一行三人在混亂中墜入天山秘洞。宋青書先后取得倚天屠龍與九陰九陽，功力大增無人能敵，張無忌與鐵真敗退后在秘洞中習得天竺九式。二人引宋青書上天山一決雌雄，最終以天竺神功第九式合力擊敗強敵，奪回秘笈平息江湖浩劫。本片根據金庸小說《倚天屠龍記》演繹而來，再現正邪較量與武林至寶爭奪的高潮終局。