某艦隊兩棲偵察兵訓練場的激烈格斗場景吸引了子弟學校學生董海星、謝潛和金寶貝。董海星翻墻偷取匕首時被軍官梁馳濤"俘獲"，次日卻發現對方成為五年級二班新輔導員。夜間宿舍違紀模擬海戰被梁馳濤嚴厲制止，董海星對輔導員的不滿加劇。作為"特混艦隊"領袖自封的三個男孩，在鯊魚礁發現神秘海底聲響，展開代號"鯊魚行動"的秘密調查。白鷗老師沒收的錄音機被梁馳濤歸還后，雙方關系出現轉機。金寶貝潛水遇險時獲梁馳濤營救，少年們對輔導員的情感發生轉變。董海星期中考試作弊被寧娜揭發，三人用洗衣粉水實施報復。在師長引導下，孩子們逐漸理解真正的男子漢需以友情為重、胸懷寬廣。梁馳濤即將調任時，學生們用《水兵之歌》送別，并在授旗儀式上獲頒"特混艦隊"班稱號，全體身著水兵服在導彈驅逐艦上完成成長儀式。