1500年，大將軍托馬斯（休·杰克曼飾）受皇后伊莎貝拉（蕾切爾·薇茲飾）委派前往新大陸尋找傳說中的"生命之樹"，堅信其汁液可賜予永生。歷經戰火與艱險抵達神秘禁地后，他目睹了超越認知的奇幻景象，卻未能及時帶回樹汁拯救病重的皇后。2000年，腦癌專家湯米（休·杰克曼飾）為拯救身患絕癥的妻子麗茲（蕾切爾·薇茲飾），從南美叢林采集到相似的樹種標本，成功提取藥物并驗證了其對黑猩猩的治療效果。2500年，湯姆·乘坐以意念操控的透明飛船穿越宇宙深淵，在瀕臨毀滅的古樹旁陷入永恒沉思，通過精神共鳴延緩其衰敗。當星云黑洞吞噬而來時，他選擇與古樹共同墜入光渦，在意識消散前目睹麗茲的幻影重現。跨越千年的執念始終指向同一命題：如何直面生命必然終結的本質。