21世紀末,人類的科技水平已高度發達,克隆人技術和宇宙航行早已實現??茖W家伊麗莎白·肖(勞米·拉佩斯飾)和查理·赫洛維(羅根·馬歇爾-格林飾)通過對古老文明的考察對比,發現人類可能是由遙遠星系的外星工程師創造。在Weyland公司資助及維克絲(查理茲·塞隆飾)掌管的宇宙飛船普羅米修斯號支持下,他們前往銀河系邊緣的未知星球??疾熘校瑘F隊不僅發現了與人類DNA完全匹配的工程師遺骸,還意外觸發了星艦內儲存的黑色液體物質。這種生物武器導致船員接連變異、死亡,并喚醒了沉睡的工程師種族。隨著真相揭開,資助者彼得·維蘭德(蓋·皮爾斯飾)親自現身尋求長生不老,卻因感染而喪命。最終人類試圖創造生命的狂妄野心遭到反噬,工程師啟動滅絕裝置意圖摧毀地球文明。肖在異形生物追殺中獨自逃生,帶著對人類起源與毀滅的雙重答案繼續踏上尋找工程師母星的孤獨旅程。