《亡靈故事》由三個獨立恐怖篇章組成。第一段中，兩名女巫為復活同伴綁架美麗女子作為祭品，在獻祭儀式上骷髏逐漸血肉重生。被囚禁的女子與神秘男子聯手反抗，最終在女巫復活儀式完成前逃脫。第二段改編自《小紅帽》，少女探訪奶奶時發現其已遭狼人襲擊并變異，兩人在林間小屋與破廟中展開追逐戰，最終狼人占據上風。第三段聚焦擁有意念控制能力的少女意外闖入畸形人家庭，這群外表怪異卻心地善良的居民與她建立深厚羈絆，在對抗貪婪地產商入侵后，眾人得以繼續隱居生活。整部影片以男孩在閣樓聽叔叔講述這些黑暗故事為框架敘事，當最后一個故事結束時，現實中的男孩突然被閣樓陰影中竄出的怪物拖入黑暗深淵。