悉尼與多年未見的母親伊琳娜·德雷夫科當面對峙，對方對女兒的危險意圖昭然若揭。逃脫后的悉尼與父親杰克、好友威爾一同逃離臺灣，回到洛杉磯后繼續尋找在臺北洪水中失蹤的戀人沃恩。威爾得知SD-6實為偽裝成CIA下屬機構的秘密組織，以及悉尼雙面間諜的真實身份后徹底改變人生軌跡。迪克西面臨是否向斯隆舉報悉尼可疑行為的抉擇，關鍵時刻杰克出手掩蓋真相。重逢后的沃恩協助悉尼追蹤正在搜尋Rimbaldi圣典"圣經"的伊琳娜，該文物被證實是蘊含重大機密的關鍵文物。隨著調查深入，悉尼發現母親與SD-6之間存在復雜關聯，而沃恩的真實身份最終也被證實是CIA特工。