《雷迪克編年史：黑暗女神》作為《暗黑巖》（2000）與《雷迪克編年史》（2004）之間的關鍵銜接作品，聚焦反英雄雷迪克在星際逃亡過程中與神秘組織"黑暗女神"的對抗。故事始于雷迪克被宇宙傭兵團流放至荒蕪星球Helion Prime，意外卷入當地原住民與跨國企業"諾頓集團"的沖突。該集團通過操控能源供給奴役星球文明，并利用生物兵器獵殺反抗者。雷迪克與原住民女戰士阿伊瑞恩結盟，逐步揭露集團通過基因實驗制造變異生物的罪行。在摧毀地下實驗室的過程中，雷迪克發現自身被植入追蹤芯片的秘密，并借助阿伊瑞恩的古老治愈儀式解除控制。最終他協助原住民摧毀能源中樞，迫使諾頓集團撤離，為后續《雷迪克編年史》中其成為星際傳奇埋下伏筆。