在《鯊卷風(fēng)5》引發(fā)的全球生態(tài)浩劫后，人類文明瀕臨崩潰邊緣。經(jīng)驗(yàn)豐富的鯊魚(yú)獵人芬·謝潑德發(fā)現(xiàn)常規(guī)武器已無(wú)法應(yīng)對(duì)變異生物威脅，被迫研發(fā)出更強(qiáng)大的等離子電鋸。當(dāng)史無(wú)前例的巨型鯊魚(yú)怪獸Sharkzilla橫掃各大洲時(shí)，芬與海洋生物學(xué)家艾莉、發(fā)明家新納德等老戰(zhàn)友意外被時(shí)空漩渦卷入平行維度。在此過(guò)程中，一位來(lái)自未來(lái)的人工智能科學(xué)家突然現(xiàn)身，揭示Sharkzilla實(shí)為失控的時(shí)間循環(huán)產(chǎn)物。眾人通過(guò)量子糾纏裝置穿越七個(gè)時(shí)空節(jié)點(diǎn)，在倫敦塔橋、撒哈拉沙漠和南極冰蓋等不同時(shí)空坐標(biāo)與Sharkzilla展開(kāi)殊死搏斗。最終芬啟動(dòng)反物質(zhì)電鋸核心，在摧毀怪獸的同時(shí)重組時(shí)空連續(xù)體，使地球生態(tài)恢復(fù)至鯊卷風(fēng)災(zāi)難前狀態(tài)。當(dāng)最后一片變異鱗片消失在量子真空，人類文明得以延續(xù)至新的紀(jì)元。