地球聯(lián)邦軍在賈布羅保衛(wèi)戰(zhàn)后展開(kāi)敖德薩攻勢(shì)期間，白色基地為執(zhí)行作戰(zhàn)補(bǔ)給任務(wù)駛向貝爾法斯特時(shí)，接收到清除"不歸之島"殘敵的臨時(shí)指令。阿姆羅·雷與戰(zhàn)友登島后，意外發(fā)現(xiàn)本應(yīng)不存在的平民兒童群體及一臺(tái)神秘扎古機(jī)體。在與偽裝成平民領(lǐng)袖庫(kù)庫(kù)魯斯·多安的吉翁殘黨遭遇戰(zhàn)中，阿姆羅因駕駛高達(dá)墜毀被迫棄機(jī)。通過(guò)接觸島上被多安庇護(hù)的戰(zhàn)爭(zhēng)孤兒，阿姆羅逐步揭開(kāi)這位前吉翁軍官為贖清戰(zhàn)罪而隱居育孤的真相。面對(duì)聯(lián)邦軍即將實(shí)施的無(wú)差別轟炸，阿姆羅協(xié)助多安完成機(jī)體修復(fù)，在最終交戰(zhàn)中成功奪回高達(dá)并帶著孩子們撤離。島嶼在爆炸中沉沒(méi)前，多安選擇與象征過(guò)往罪孽的扎古一同消失于火海。