草帽海賊團在航行途中，娜美偶然獲得一張珍獸島藏寶圖。盡管喬巴以該島存在未知危險為由強烈反對，路飛等人仍決定前往尋寶。途中海底火山爆發掀翻船只，眾人意外被拋至珍獸島。這座島嶼由能說人語的動物族群統治，因老國王麒麟獅去世而陷入權力真空。喬巴誤打誤撞被群獸擁立為新王，雖百般推辭仍被迫接受統治權。正當動物們慶祝新王誕生時，前國王顧問巴特拉伯爵率軍登陸。這位篡位者以尋找傳說中的"國王寶藏"為名，對珍獸島實施血腥掠奪。草帽海賊團與巴特拉勢力爆發激烈沖突，喬巴在路飛等人協助下識破反派陰謀。最終眾人合力挫敗伯爵的征服計劃，珍獸島重歸和平，喬巴也完成從醫生到領袖的成長蛻變。本片改編自尾田榮一郎原作，為2002年推出的第三部劇場版動畫。