這兩位宛如神祇一般強大的對手于一場壯觀的戰爭中相遇，彼時世界命運正懸于一線。為了找到真正的家園，金剛與他的保護者們踏上了一次艱難的旅程。與他們一道前行的還有一個年輕的孤兒女孩——吉雅，這個女孩與金剛之間存在著一種獨特而強大的緊密聯系。但意想不到的是，他們在前行的航道上與憤怒的哥斯拉狹路相逢，也由此在全球引起了一系列破壞。一股無形的力量造成了這兩只巨獸之間的巨大沖突——人類勢力暗中操控泰坦能量的實驗意外觸發了地核震蕩，深藏在地心深處的奧秘也由此揭開。隨著史前文明遺跡與泰坦巨獸起源真相的浮現，金剛最終在吉雅幫助下喚醒遠古之力，在與哥斯拉展開終極對決后，重新確立了地球生態系統的平衡秩序。