《美眉校探第三季》于2006年10月3日至2007年1月20日期間在UPN電視臺(tái)播出，共20集。本季延續(xù)講述高中生偵探維羅妮卡·瑪斯在解決校園爆炸案后，持續(xù)調(diào)查連環(huán)失蹤事件及校內(nèi)秘密社團(tuán)陰謀的主線(xiàn)劇情。隨著她深入追查，維羅妮卡發(fā)現(xiàn)父親基思·瑪斯的政敵與案件存在關(guān)聯(lián)，并遭遇神秘組織"債務(wù)清算人"（Debit & Credit）的威脅。故事貫穿她兼顧私家偵探工作、應(yīng)對(duì)與洛根·埃克斯關(guān)系變化，以及協(xié)助父親競(jìng)選警長(zhǎng)的三重矛盾。季終集揭示爆炸案幕后主使身份，并展現(xiàn)維羅妮卡通過(guò)破解加密線(xiàn)索成功營(yíng)救被綁架的基思，同時(shí)揭露犯罪組織與地方政府勾結(jié)的事實(shí)。該季以維羅妮卡的畢業(yè)典禮及對(duì)小鎮(zhèn)權(quán)力結(jié)構(gòu)的沖擊作為收尾，為后續(xù)劇情留下開(kāi)放性結(jié)局。