公元2010年超級(jí)颶風(fēng)引發(fā)全球性災(zāi)難，世界人口從80億銳減至30億，地理格局劇變。日本通過建立經(jīng)濟(jì)特區(qū)與"力量輔助"技術(shù)實(shí)現(xiàn)局部復(fù)興，但統(tǒng)治階級(jí)Logos將貧困階層Levinas視為排斥對(duì)象，并將軍用化的該技術(shù)用于階級(jí)統(tǒng)治。2035年，前特殊部隊(duì)"幻影"成員葛城丈與戰(zhàn)友鶴澤脫離組織，在逃亡途中偶遇神秘少女登戶沙那。隨著Logos對(duì)Levinas的鎮(zhèn)壓升級(jí)，三人被迫卷入階級(jí)戰(zhàn)爭(zhēng)的核心地帶。沙那體內(nèi)潛藏的特殊基因信息成為雙方爭(zhēng)奪的關(guān)鍵，其真實(shí)身份關(guān)聯(lián)著"力量輔助"技術(shù)的起源與失控危機(jī)。丈為保護(hù)沙那而對(duì)抗昔日同僚，在階級(jí)對(duì)立、技術(shù)倫理與人性存亡的漩渦中，被迫直面自己參與構(gòu)建的暴力系統(tǒng)。當(dāng)沙那作為"維納斯計(jì)劃"核心載體的身份揭曉時(shí)，三人組的抉擇直接牽動(dòng)著Logos與Levinas勢(shì)力平衡的最終走向。