毒液與埃迪·布洛克（湯姆·哈迪 飾）陷入雙重危機。人類秘密組織以新型反共生體武器展開圍剿，而外星共生體母族群則因前作中屠殺釋放的信號啟動地球入侵計劃。這對備受追捕的共生體與宿主被迫突破極限，通過深度融合解鎖海陸空三棲戰斗形態，在舊金山展開大規模破壞性反擊。隨著共生體艦隊降臨大氣層，埃迪與毒液必須直面共生關系的終極考驗——既要阻止母族群同化地球，又要防范人類武裝的致命威脅。在雙方勢力的夾擊中，他們選擇以自我犧牲為代價觸發共生體湮滅協議，在最終決戰中摧毀母族群核心控制節點，同時將人類反派首腦與共生體艦隊一同拖入湮滅漩渦。這場雙線作戰的生死博弈以共生體與宿主的融合形態消亡告終，為地球贏得喘息之機。