在《謎你實驗室第二季：不要停！》中，天才科學家王吉平與搭檔赫小哈、計林繼續帶領觀眾探索未知領域。面對持續蔓延的全球性疫情危機，三人組堅守實驗室陣地，在研發病毒檢測技術的過程中意外發現微觀世界的能量法則。隨著新型變異株的爆發，他們被迫將實驗室改造成移動科研站，在城市廢墟間穿梭采集數據。赫小哈通過解碼病毒基因鏈揭示了疫情與百年前科學實驗的隱秘關聯，計林則在機械改造中突破常規能源限制。團隊在破解謎題的旅途中遭遇身份不明的追蹤者，發現實驗室創始人的塵封手稿中記載著跨越時空的科學倫理悖論。最終他們選擇將研究成果開源共享，在持續不斷的探索與創造中傳遞知識火種，用科學精神對抗恐懼與停滯。