《特殊失蹤專案組：失蹤的黑色M》以1%極端罕見的惡性失蹤案件為背景，聚焦FBI出身IQ高達(dá)187的天才刑警吉秀賢（金康宇飾）與本土實(shí)戰(zhàn)派刑警吳大榮（樸熙順飾）組成的專案組搭檔。兩人在限期破案的壓力下，追蹤涉及連環(huán)模仿犯罪手法的失蹤案件時(shí)，發(fā)現(xiàn)所有線索均指向看似完美卻暗藏系統(tǒng)性漏洞的社會(huì)結(jié)構(gòu)。隨著調(diào)查深入，吉秀賢母親二十年前的失蹤疑云與現(xiàn)案形成鏡像關(guān)系，而以黑色M為代號(hào)的犯罪者真實(shí)身份竟與警方內(nèi)部存在復(fù)雜勾連。劇集通過懸疑案件逐步揭露醫(yī)療腐敗、權(quán)力庇護(hù)等社會(huì)陰暗面，在尋找失蹤者物理位置的同時(shí)，展開對(duì)制度性正義缺失的深層追索。最終專案組以突破常規(guī)調(diào)查手段瓦解犯罪網(wǎng)絡(luò)，并促使相關(guān)失蹤者法案得以修訂。