就讀穗群原學園的普通女生伊莉雅意外與人工天然精靈魔法露比萬花筒之杖締結契約，被迫成為持有紅寶石之星的魔法少女，并受原主人遠坂凜支配回收職階卡片。同期參與任務的還有芬蘭魔術世家艾德費爾特的露維亞，兩人因寶石魔術天賦相近卻個性迥異始終處于對立狀態。某日伊莉雅遭遇逃逸的萬花筒之杖后，被強制變身成新任紅寶石持有人，在完成儀式過程中因意外導致地脈紊亂，分離出名為克洛伊·馮·愛因茲貝倫的實體化人格。該人格皮膚黝黑、銀發裸露裝束近似Archer，性格狡猾且初期試圖抹殺本體伊莉雅未果，被凜以血印詛咒制服后轉入其班級。魔法露比作為第二魔法應用的頂級魔術禮裝，具備多元轉變能力，可賦予使用者A級障壁、身體強化等常備技能。伊莉雅日常熱衷觀賞魔法少女動畫，短跑雖勝過男生卻不及美游，其母為少數能識破克洛伊偽裝者。隨著卡片回收進程推進，凜因寶石耗盡暫居露維亞宅邸擔任女仆，并與士郎產生微妙情愫，而三方勢力的糾葛仍在持續。