某日野原新之助（矢島晶子配音）在公園與風間（真柴摩利配音）、妮妮（林玉緒配音）玩耍時，偶遇自稱來自未來的神秘女子金有久美子（釘宮理惠配音）。對方告知小新，成年后的自己正是她的未婚夫，并帶其穿越至科技發達的未來世界。在此發現金有集團社長金有增藏（玄田哲章配音）為掌控政權綁架了成年新之助，并企圖抹殺知曉真相的小新一行。面對增藏派出的精英刺客，小新與伙伴們借助未來道具展開救援行動，在關鍵對抗中意外觸發時空悖論。最終小新通過招牌的屁股舞動作激活反重力裝置，與未來同伴合力摧毀增藏的秘密武器，成功解救被困的成年新之助并修復了被扭曲的時間線，使籠罩在未來都市上空的陰霾得以消散。