七歲男孩貝蒂爾因父母工作獨(dú)自在家感到孤獨(dú)，成為家中獨(dú)子后始終無(wú)法走出姐姐瑪莎病逝的陰影。某日他在閣樓發(fā)現(xiàn)來自地窖的小矮人尼爾斯·卡爾森·皮西林，兩人迅速建立深厚友誼。這個(gè)擁有魔法的微型房客居住在殘忍老鼠喬夫桑出租的地下室房間，通過操控時(shí)間碎片維持生計(jì)。貝蒂爾在幫助尼爾斯修繕房屋的過程中重拾生活樂趣，而小矮人則借助人類伙伴對(duì)抗貪婪的房東。隨著兩人合作修復(fù)被喬夫桑破壞的時(shí)間裝置，原本封閉的地窖逐漸變成充滿歡笑的秘密基地。最終在圣誕夜的魔法時(shí)刻，尼爾斯贈(zèng)予貝蒂爾承載美好回憶的時(shí)間膠囊，兩個(gè)不同維度的生命在相互溫暖中完成了對(duì)家庭缺憾的療愈。