《無間道》正序版，影片全長315分鐘，正如其名，是將三部曲的內容全部整理一遍，按時間順序來展現《無間道》的故事，應該說，這是一個頗為有趣的構思。這個版本并非導演剪輯的，而是DVD發行商鉅星公司，除了時間順序，并無任何改動之處。該版收錄在《無間道·終極珍藏版》（八碟套裝）的第7、8碟之中，市面將這兩碟單獨出售的目前有“新帝景”版和“勝者”版。本來還以為由DVD發行商來剪輯，效果一定很出色，結果卻大失所望，剪輯手法非常生硬，只能稱三流，不過簡單地將畫面調一下順序，沒有什么技術含量，很多業余網友都能剪輯得更好，像這種層次的水平筆者也能達到。就來說說幾個我覺得剪輯得特別不好的地方吧。1：（第1碟）故事起于《無間道2》，這點不用多說了，然后到了大約27分左右，MARY的情節后出現了警校的訓練場景，這段內容是《1》的，由于音樂比較激昂，與之前的平靜鏡頭格格不入，如果把音樂去掉會更好些。不過接下來的剪輯就很絕妙了，陳永仁發現黃志誠的襪子問題后，畫面切換到了《2》葉校長找阿仁談話的場景（即指出他和倪家有血緣關系），這一段連接得非常自然，完全不會因為音樂的突然中止而讓人感到別扭。2：《無間道2》的故事全部結束后，根據原來的設定播放起了《被遺忘的時光》，緊接著馬上切換到了《1》開頭警校里劉健明軍訓的場景，沒幾秒后，又開始播放《3》的開頭陳永仁打人的場景，這一段的剪輯可謂超級沒水準，要說有多粗糙就有多粗糙，干脆把那十幾鈔的警校場景刪掉效果肯定會更好些。3：（緊接著第2條）好了，這個版本被稱作“正序版”對吧，《3》的“回憶”部分的劇情發生在《1》之前，所以在《2》結束后先行播放，這個沒問題，但無厘頭的是，阿仁打人的場景播放完畢后，居然出現了“阿永仁殉職前XX個月”這樣的字幕！好吧，你水平不夠，沒能消掉字幕，那么這畫面持續了好幾秒，你消掉幾楨別讓這穿越時空的字幕出現總沒問題吧？！4：（第2碟）正式進入《1》的劇情，一開頭是短暫的《3》的片尾，就是陳永仁走進CD店的那一段，這里又出現了提示阿仁已經掛掉的“穿越字幕”……5：《1》的故事末尾，陳永仁死后，他的葬禮出現前插入楊錦榮和沈澄在樓頂上的對話，個人感覺這處地方有點節外生枝，而且“正序”畢竟不等于“編年”，適當運用少量倒敘也不是問題。在此贊賞一下之后的剪輯，劉健明對著陳永仁的墓碑敬禮后，畫面突然花屏，接著提示劇情到了2003年，進入了《3》的“現在”部分，這一段剪得太妙了。基本上就是這幾處明顯的硬傷，其他地方的剪輯大體沒什么毛病。盡管剪輯手法很平庸，但也有不少網友表示還算滿意，主要原因是很多人看不懂《無間道3》的劇情（片中的時間順序極為混亂），經過時間調整后，總算變得讓人容易明白一些。而且連續五個小時下來，亦頗有一種史詩感，仿佛在觀看一群人的一生。《無間道3》我看過好幾遍，但一直都沒能把當中的劇情理清頭緒，很多情節看過就忘掉了，這次居然通過正序版搞明白了這個故事到底想說什么，《3》的劇情頭一次不再讓我感到乏味，真有夠意外的……雖然因為時間順序的問題，楊錦榮和沈澄的身份提早被透露，但至少比看得不明不白好多了。沒有了這二人的身份懸念后，《3》的劇情剩下的看點大概只有劉健明如何反偵察及其心理矛盾，但這已足夠了。要是劉大導本人能夠來親自剪輯一下時間順序版，那就更有意思了。