《軍情五處第九季》開場于資深特工羅絲（赫敏·諾里斯飾）的葬禮，哈里（彼得·弗斯飾）在此時驚悉軍情五處高層存在致命背叛。本季主線圍繞多重危機展開：特工團隊全力追捕索馬里恐怖分子侯賽因·阿比布（彼得·班克斯飾），盧卡斯（理查德·阿米蒂奇飾）深埋的過往秘密被揭開并引發嚴重后果，資深分析師露絲（妮可拉·沃克飾）與哈里在共同應對危機中逐漸靠近。新晉特工貝絲（索菲婭·邁爾斯飾）與德米特里（馬克斯·布朗飾）的加入為行動注入變數。全季貫穿哈里面對內部叛徒與外部威脅的雙重壓力，以及盧卡斯過去行動導致的關鍵線人遇害事件，最終通過破解外交官文斯·馬登（肖恩·賓飾）策劃的跨國陰謀，使軍情五處核心團隊在重大犧牲后完成重建。