NIGHTHEAD指人類未開發的70%腦容量，蘊藏著超自然力量。霧原直人與弟弟直也自幼被囚禁于研究所，憑借岬老人設置的結界維持15年封閉生活。直人擁有念動力，直也具備讀心術與預知能力，在老人去世后突破結界逃往外界。兩人在東京郊外公寓定居，卻因特殊體質持續吸引負面能量實體化形成的"夜行者"。神秘少女雙海翔子作為引導者出現，揭示直人預知中反復閃現的"變革"圖景。隨著政府秘密組織接連介入，兄弟發現研究所持續制造超能力者的黑暗真相，而追蹤者美崎的真實身份與動機逐漸浮出水面。在直也預知的末日景象逼近時，三人被迫直面超能力者與普通人類共存的可能性邊界。