1937年12月13日，南京城淪陷后，宋錫濂部軍官陸劍雄（劉燁飾）率殘兵展開巷戰，最終被日軍壓制并集體處決；金陵女子學院安全區女教師姜淑云（高圓圓飾）在保護難民過程中遭日軍強奸致死；拉貝秘書唐先生（范偉飾）為保全家人被迫與日軍合作，最終在絕望中選擇自殺；舞女小江（江一燕飾）為保護安全區女性自愿前往慰安所；日本士兵角川（中泉英雄飾）目睹屠殺暴行后，在釋放兩名中國戰俘及慰安婦后自殺。影片通過多線敘事展現南京大屠殺中不同身份人物的命運抉擇，最終以各角色的悲劇性結局勾勒出戰爭對人性的摧殘。