在近未來的東京圣誕夜，自稱宇宙生物研究者的神秘男子突然現身并卷入連環殺人案。警視廳搜查一課組長松本與搭檔田中發現死者體內均存在未知金屬粒子，隨著調查深入，他們逐漸察覺這起案件與十年前墜毀的隕石、某跨國企業秘密開發的生化兵器計劃，以及自稱來自毀滅星球的外星逃亡者存在復雜關聯。調查過程中警方意外發現，這群偽裝成人類的外星生命體內部存在分裂勢力，部分個體因接觸地球文明產生認知異變。在最終決戰的新宿都廳大廈頂端，松本與外星領袖展開生死對決，同時被迫面對科學與倫理的終極抉擇——當人類發現宇宙并非唯一智慧生命時，該如何定義自身的存在價值。