《勇者王FINAL 05年修改版》承接原作世界觀，講述地球防衛組織GGG與機械獅子GaoGaiGar的駕駛員高杉星司對抗宇宙威脅的故事。劇情從第1話"勇者王新生"展開，展現高杉在經歷前作事件后獲得全新力量。第2話"奇跡的傳說"揭示了勇者王機體改造與星司意識覺醒的關鍵過程。第3話"破壞神嵐的決戰"呈現與敵對勢力Zonder King部隊的首次大規模沖突，暴露出對方奪取地球核心能源的陰謀。隨著第4話"GGG放逐命令"中高層決策分歧，高杉被迫以非常規手段應對危機。第5話"心ANIMUS"通過隊友我王凱牙的調查，揭露敵方首領與初代勇者王戰士存在深層關聯。高潮部分第6話"勇者王的最后時刻"至第9話"吾名GENESIC"，展現機體暴走、核心成員犧牲及敵我雙方真實身份的逆轉。最終三話以"超勇者默示錄""超越生命的存在"直至"神話"收束，通過白色J方舟的復活與宇宙能量重組，完成對生命循環主題的終極詮釋。