熊貓星球百年慶典期間，鼠司令突襲將全體熊貓變?yōu)樾〕?。太空熊貓（易小寅飾）與伙伴們逃至地下秘密基地，發(fā)現(xiàn)需尋找傳說中的神器方能恢復(fù)族群。鼠司令為奪取神器派出精銳部隊(duì)，并設(shè)下重重陷阱阻撓。太空熊貓與敖磊、左昕祺等同伴穿越危險區(qū)域，在李溯意外觸發(fā)的古代機(jī)關(guān)中獲得關(guān)鍵線索。雷鬼與張馨予識破鼠軍內(nèi)部陰謀，為隊(duì)伍爭取寶貴時間。雙方在懸浮神殿展開決戰(zhàn)，神器啟動需熊貓族群集體意念共鳴的設(shè)定被揭曉。在倒計(jì)時內(nèi)，眾人用慶典燈籠組成能量矩陣喚醒沉睡的熊貓意識，最終以集體精神力激活神器。失控的能量風(fēng)暴摧毀鼠司令機(jī)械戰(zhàn)甲核心，其臨終懺悔揭示入侵源于被篡改的歷史記憶。熊貓族群恢復(fù)原貌后重建家園，太空熊貓將神器封存至新的隱秘維度。