本片是一部將偉大的搖滾樂隊披頭士的音樂和波普視覺藝術完美結合而成的二維插畫風格動畫片，整部片子中共穿插了披頭士的15首經典歌曲。影片講述了披頭士成員保羅·麥卡特尼在半夢半醒之間來到花椒國，這是一個討厭音樂的地方，正遭遇藍色惡魔的侵略。老船長弗萊德召集披頭士成員一同乘坐黃色潛水艇共同保衛花椒國。影片開頭用喬治·馬丁的弦樂描述祥和的花椒國，接著由林格·斯塔爾演唱的《黃色潛水艇》象征著花椒人民的朝氣蓬勃。藍色惡魔摧毀了花椒國的音樂與和平，老船長征召披頭士成員通過《一起來吧》的旋律集結眾人。披頭士裝扮成花椒軍士在《帕伯軍士孤獨之心俱樂部樂隊》的音樂中擊潰敵人，最終以"你需要的就是愛"的主題曲拯救了花椒國。所有披頭士成員在影片結尾共同演奏《所有的愛》宣告勝利，黃色潛水艇重新啟航。